מדרשת בכנפיה היא מקום מיוחד וקסום. המדרשה מיועדת לבנות המחפשות להתפתח ולגלות את עצמן ואת מקומן בחברה הישראלית ובעולם התורה והעקרונות היהודיים. כאן, לצד החברויות שמתווצרות במדרשה, מקבלות הבנות תמיכה והנחיה, ומתפתחות לאורך דרכן הרוחנית. בעיקרי הלימוד, הדיבוק בחברויות, והחיבור לחכמי התורה, מדרשת בכנפיה היא מקום נפלא להתפתחות רוחנית ואישית. באמצעות חקירת נושאים עמוקים והתעמקות בתורה, כל בת מדרשה מוצאת את העצמאות שלה ומביאה את יכולותיה ואישיותה לידי ביטוי, תוך תרומתה לשלמות העם היהודי.

הרצי"ה (הרב צבי יהודה הכהן קוק) היה אומר שעיקר מצוות לימוד תורה של נשים הוא לימוד אמונה.  כך במדרשה שלנו עיקר הדגש הוא על לימוד, העמקה ובניין האמונה. אנחנו מקיימות לימוד מונחה בחברותות, שיעורים בספרי יסוד באמונה כמו המהר"ל, כתבי הרב זצ"ל וחסידות, וכמובן, שיעורים על נושאים אמוניים אקטואלים. אנו לומדות במדרשה מהיסודות ולעומק הדברים על מנת לבנות את העולם האמוני בצורה המדויקת לנפש של כל אחת ואחת. 

במדרשת בכנפיה אנחנו רואים את ההתנדבות כדרך חיים. במדרשה יש מועדונית לילדים עם צרכים מיוחדים מהר חברון שהבנות במדרשה אחראיות עליה ועל תפעולה, והינה חלק מלו"ז המדרשה ומתקיימת פעם בשבוע. המועדונית היא זמן של צחוק, דיבור, משחק, פעילות וקידום אישי של הילד מתוך אהבה ואמונה בו.  תורת החסד ועזרה למי שסביבנו היא לגמרי חלק מהמדרשה שלנו בין אם זה לעזור למשפחות או לתרום את חלקנו בחווה. בנוסף, ישנן בנות שבוחרות להתנדב בחקלאות באזור ולקיים מצוות עבודת הארץ.

במדרשת בכנפיה, הלב הוא בית המדרש שלנו. זה המקום שבו אנו נוגעים ומעמיקים במהות העצמית, התורה והיהדות. בנוסף ללימודים, אנו מציעים סדנאות מגוונות כגון מחול, כתיבה, אומנות והתעמלות. בנוסף, אנו יוצאים לסיורים וטיולים בהם אנו מתחברות ללימודים באופן מקורי. אנו מתהלכות במקומות שבהם הלך דוד המלך, רואות בעיניים את המקומות שלמדנו עליהם בבית המדרש, ומעמיקות בקדושת הארץ בדרך ייחודית ומרתקת.